Arginine là một axit amin cơ bản nên thường tồn tại ở dạng tích điện dương. Nó cũng là axit amin phổ biến nhất tại các vị trí protein liên kết với DNA (mang điện tích âm). Loại protein nào sau đây ít có khả năng liên kết ADN nhất?
Hãy suy nghĩ và trả lời câu hỏi trước khi xem đáp án
Lời giải:
Báo saiATP synthase nằm ở màng trong ty thể và không có khả năng tiếp xúc với DNA trong những trường hợp bình thường.
Tương tác protein-DNA rất quan trọng trong việc điều chỉnh sự đóng gói chất nhiễm sắc (ví dụ như histone), sao chép DNA và phiên mã gen (ví dụ CAP và yếu tố phiên mã IIB). Nhóm guanidium của arginine có xu hướng liên kết các vùng giàu AT và (cho đến nay) là axit amin được làm giàu nhất tại các vùng liên kết DNA của protein. Ở mức độ cơ bản, điều này không có gì đáng ngạc nhiên, vì DNA mang điện tích âm (do các nhóm phốt phát của nó). Arginine cũng hữu ích trong việc liên kết DNA vì nó có thể chấp nhận và cung cấp liên kết hydro. Các axit amin hình thành liên kết hydro ở cạnh Hoogsteen của gốc nucleotide (cạnh "trên cùng" của nucleotide như chúng thường được vẽ). DNA được sắp xếp theo cách có rãnh chính và rãnh phụ. Ở dạng phổ biến nhất (dạng B), trình tự nucleotide của DNA khác biệt ở rãnh chính, nhưng là mơ hồ trong rãnh nhỏ. Do đó, các protein liên kết với DNA theo cách thức cụ thể theo trình tự nucleotide phải liên kết qua rãnh chính (mặc dù tương tác với rãnh phụ cũng có thể xảy ra để tăng ái lực liên kết).
