Protein như trypsin và chymotrypsin rất quan trọng trong chức năng cơ thể cũng như trong sinh học phân tích. Cơ chế sinh hóa của chúng được xác định bởi một axit amin tại vị trí hoạt động của chúng mà nhóm protease này được đặt tên. Đây là axit amin nào?
Hãy suy nghĩ và trả lời câu hỏi trước khi xem đáp án
Lời giải:
Báo saiTrypsin, chymotrypsin, thrombin và acetylcholinesterase đều là protease serine, vì chúng có dư lượng serine tại vị trí hoạt động có chức năng như một nucleophile (một chất cho cặp điện tử). Protease serine thực sự được xác định bởi ba gốc tại vị trí hoạt động của chúng - Ser195, Asp102 và His57 - được gọi chung là bộ ba xúc tác. Làm việc cùng nhau, ba gốc này dẫn đến sự thủy phân các liên kết peptit, liên kết này liên kết các axit amin với nhau trong protein.
Các protease serine thủy phân các liên kết peptit thông qua cùng một cơ chế sinh hóa. Tuy nhiên, mỗi loại enzym được liệt kê ở trên đều có cơ chất cụ thể. Ví dụ, trypsin phân cắt các liên kết peptit trực tiếp sau các axit amin tích điện dương (lysine và arginine), trong khi chymotrypsin phân cắt sau các gốc kỵ nước cồng kềnh (phenylalanin, tryptophan, v.v.). Tính đặc hiệu này được xác định bởi một túi liên kết axit amin. Túi này trong trypsin dài, hẹp và chứa một nhóm cacboxylate tích điện âm ở cuối, làm cho nó hoàn toàn phù hợp với chuỗi bên của lysine hoặc arginine.
