Đối với trường hợp người nộp thuế tự xác định số tiền thuế được miễn thuế, giảm thuế, việc nộp và tiếp nhận hồ sơ miễn, giảm thuế được thực hiện như sau:

Điều 27 Luật Tố cáo 2018 quy định về việc thụ lý tố cáo:
1. Tố cáo thuộc thẩm quyền giải quyết của cơ quan, tổ chức, cá nhân thì phải được thụ lý để giải quyết; trường hợp không thuộc thẩm quyền thì phải chuyển đến cơ quan, tổ chức, cá nhân có thẩm quyền để giải quyết trong thời hạn 05 ngày làm việc kể từ ngày nhận được tố cáo.
2. Tố cáo không thuộc một trong các trường hợp sau đây thì không được thụ lý giải quyết:
a) Tố cáo về hành vi vi phạm pháp luật đã có quyết định giải quyết theo đúng quy định của pháp luật;
b) Tố cáo đã được tòa án thụ lý hoặc đã được giải quyết bằng bản án, quyết định của tòa án;
c) Người tố cáo sử dụng họ tên của người khác để tố cáo;
d) Người tố cáo không có năng lực hành vi dân sự đầy đủ;
e) Nội dung tố cáo không rõ ràng, không có căn cứ để xác định người vi phạm, hành vi vi phạm pháp luật;
f) Tố cáo đã được cơ quan, tổ chức, đơn vị kiểm tra, thanh tra và kết luận rõ ràng về nội dung tố cáo.
3. Khi nhận được tố cáo không thuộc trường hợp được thụ lý giải quyết quy định tại khoản 2 Điều này, người tiếp nhận phải thông báo ngay cho người tố cáo biết rõ lý do không thụ lý.

Trong trường hợp này, đơn tố cáo không có chữ ký trực tiếp mà chỉ có bản sao chụp chữ ký. Như vậy, nội dung tố cáo không đủ điều kiện thụ lý giải quyết theo quy định của pháp luật.

Theo quy định của pháp luật về thuế, khi đã quá thời hiệu xử phạt vi phạm hành chính về thuế thì người nộp thuế sẽ không bị xử phạt nữa. Điều này nhằm đảm bảo tính công bằng và ổn định trong việc áp dụng pháp luật.

Biện pháp cưỡng chế khấu trừ một phần tiền lương hoặc thu nhập thường được áp dụng đối với cá nhân. Doanh nghiệp và tổ chức thường có nhiều hình thức tài sản khác để thực hiện cưỡng chế, trong khi cơ quan chi trả tiền lương và thu nhập không phải là đối tượng bị cưỡng chế mà là bên thực hiện việc khấu trừ theo yêu cầu của cơ quan có thẩm quyền.

Cả ba trường hợp được nêu đều là những tình huống mà cơ quan thuế có thể tiến hành thanh tra thuế. Do đó, đáp án đúng là "Cả 3 trường hợp trên".

- Đối với doanh nghiệp có ngành nghề kinh doanh đa dạng, phạm vi kinh doanh rộng: Việc này có thể làm tăng nguy cơ sai sót hoặc gian lận trong kê khai và nộp thuế, do đó cơ quan thuế có thể thanh tra.

- Khi có dấu hiệu vi phạm pháp luật về thuế: Đây là một lý do chính đáng để cơ quan thuế tiến hành thanh tra nhằm xác minh và xử lý các vi phạm.

- Để giải quyết khiếu nại, tố cáo hoặc theo yêu cầu của thủ trưởng cơ quan quản lý thuế các cấp hoặc Bộ trưởng Bộ Tài chính: Thanh tra có thể được thực hiện để làm rõ các vấn đề được nêu trong khiếu nại, tố cáo hoặc theo yêu cầu của cấp trên.