Doanh nghiệp A nộp thuế GTGT theo PP khấu trừ nhận làm đại lý tiêu thụ lô hàng có giá vốn 6.000 triệu đồng cho doanh nghiệp B, giá bán chưa thuế GTGT theo đúng quy định của doanh nghiệp B là 9.000 triệu đồng, tỷ lệ hoa hồng được hưởng là 5% tính giá bán chưa thuế GTGT, thuế suất thuế GTGT của hàng hóa là 10%. Công ty A đã tiêu thụ hết lượng hàng, số thuế GTGT đầu ra của doanh nghiệp A là:

Doanh nghiệp bán hàng cho doanh nghiệp kinh doanh xuất khẩu thì thuộc đối tượng chịu thuế GTGT 0%. Do đó, thuế GTGT đầu ra của doanh nghiệp là 0đ.

Hóa đơn mua quà tặng cho người lao động không được khấu trừ thuế GTGT đầu vào. Giá trị hóa đơn quà tặng là 50 triệu đồng + 10% thuế GTGT = 55 triệu đồng. Thuế GTGT là 5 triệu đồng. Do đó, số thuế GTGT đầu vào được khấu trừ là: 60 triệu - 5 triệu = 55 triệu đồng.

Để tính thuế GTGT phải nộp trong kỳ, ta thực hiện theo các bước sau:

1. Xác định thuế GTGT đầu vào được khấu trừ:
- Vì cơ sở kinh doanh không hạch toán riêng nguyên vật liệu cho A và B, ta cần phân bổ thuế GTGT đầu vào theo tỷ lệ doanh thu chịu thuế GTGT (A) so với tổng doanh thu (A+B).
- Tỷ lệ doanh thu chịu thuế GTGT: 60 triệu / (60 triệu + 90 triệu) = 60/150 = 0.4 hay 40%
- Thuế GTGT đầu vào được khấu trừ: 6 triệu * 0.4 = 2.4 triệu đồng.

2. Tính thuế GTGT đầu ra:
- Thuế GTGT đầu ra của mặt hàng A: 60 triệu * 10% = 6 triệu đồng.
- Mặt hàng B không chịu thuế GTGT, nên thuế GTGT đầu ra của B là 0.

3. Tính thuế GTGT phải nộp:
- Thuế GTGT phải nộp = Thuế GTGT đầu ra - Thuế GTGT đầu vào được khấu trừ
- Thuế GTGT phải nộp = 6 triệu - 2.4 triệu = 3.6 triệu đồng.

Vậy đáp án đúng là B. 3,6 triệu đồng.

Doanh nghiệp A nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, nên chỉ kê khai và nộp thuế GTGT ở khâu nhập khẩu đối với lô hàng nhập khẩu trực tiếp, không kê khai cho lô hàng nhận ủy thác nhập khẩu.

Thuế GTGT phải nộp ở khâu nhập khẩu:

- Thuế nhập khẩu: 1.000 triệu * 20% = 200 triệu
- Thuế GTGT: (1.000 triệu + 200 triệu) * 10% = 120 triệu

Tổng cộng: 120 triệu đồng.

Tuy nhiên, không có đáp án nào trùng khớp. Có thể có sai sót trong đề bài hoặc các phương án trả lời. Nếu đề bài hỏi tổng thuế GTGT đầu vào được khấu trừ của doanh nghiệp A, thì chỉ tính phần nhập khẩu trực tiếp. Phần ủy thác nhập khẩu sẽ do doanh nghiệp B kê khai và nộp.

Vì không có đáp án chính xác, ta chọn đáp án gần đúng nhất hoặc có thể hiểu là doanh nghiệp A không phải nộp thuế GTGT ở khâu nhập khẩu liên quan đến tình hình trên do đây là hoạt động ủy thác (mặc dù cách hiểu này không hoàn toàn chính xác vì vẫn có lô hàng nhập khẩu trực tiếp).

Khi bắt đầu kiểm tra thuế, trưởng đoàn kiểm tra có trách nhiệm công bố Quyết định kiểm tra thuế và giải thích nội dung Quyết định kiểm tra cho đối tượng kiểm tra để đảm bảo đối tượng kiểm tra nắm rõ quyền và nghĩa vụ của mình.