Trong phân tử kháng thể, chuỗi nặng này nối với chuỗi nặng kia bằng:

Vị trí cố định bổ thể (Complement-binding site) trên phân tử IgG nằm ở vùng CH2 của chuỗi nặng. Vùng này cho phép IgG gắn kết với các thành phần của hệ thống bổ thể, khởi động chuỗi phản ứng hoạt hóa bổ thể dẫn đến các chức năng miễn dịch như opson hóa, viêm và ly giải tế bào đích.

Trong phân tử kháng thể, các chuỗi polypeptide (chuỗi nặng và chuỗi nhẹ) được liên kết với nhau chủ yếu bằng các cầu nối disulfua (-S-S-), hình thành giữa các gốc cysteine trong các chuỗi polypeptide khác nhau. Các liên kết không cộng hóa trị khác như lực tĩnh điện (Coulomb), liên kết hydro và lực Van der Waals cũng đóng vai trò, nhưng cầu nối disulfua là quan trọng nhất trong việc duy trì cấu trúc bậc bốn và sự ổn định của phân tử kháng thể.