Trong kỹ thuật TMA, enzyme nào được sử dụng:

Trong các phương án được đưa ra:

• PCR (Phản ứng chuỗi polymerase): Là kỹ thuật nhân bản DNA, được sử dụng rộng rãi trong nhiều ứng dụng khác nhau, bao gồm phát hiện sự hiện diện của một đoạn DNA cụ thể, khuếch đại DNA để giải trình tự, và phân tích biểu hiện gen. Tuy nhiên, PCR không phải là phương pháp chính để xác định trực tiếp điểm đột biến trong trình tự đích.
• LCR (Phản ứng chuỗi ligase): Là một kỹ thuật khuếch đại gen sử dụng DNA ligase để nối các oligonucleotide (đoạn DNA ngắn) lại với nhau khi chúng lai hoàn toàn khớp với trình tự đích. LCR có độ đặc hiệu cao và rất hữu ích trong việc phát hiện các đột biến điểm hoặc các biến thể trình tự nhỏ. Nếu có đột biến tại vị trí lai, các oligonucleotide sẽ không liên kết được với nhau một cách hiệu quả, do đó có thể phát hiện ra điểm đột biến.
• TMA (Phiên mã trung gian khuếch đại): Là một kỹ thuật khuếch đại RNA sử dụng enzyme phiên mã ngược và RNA polymerase. TMA chủ yếu được sử dụng để khuếch đại RNA hơn là DNA, do đó không phải là lựa chọn tốt nhất để xác định điểm đột biến trong trình tự DNA đích.
• CPR (Phản ứng cộng hưởng): Không phải là một kỹ thuật phổ biến hoặc được công nhận rộng rãi trong sinh học phân tử hoặc di truyền học.

Như vậy, LCR (Phản ứng chuỗi ligase) là phương pháp hữu ích nhất để xác định điểm đột biến trong trình tự đích nhờ độ đặc hiệu cao và khả năng phân biệt các trình tự DNA có sự khác biệt nhỏ.

Trong các phương pháp khuếch đại, LCR (Ligase Chain Reaction) cho số lượng mẫu ít nhất, trong khi TMA (Transcription-Mediated Amplification) cho số lượng mẫu nhiều nhất.