Về hình thái học, để chẩn đoán phân biệt bướu cổ đơn thuần và bệnh Basedow, chủ yếu dựa vào:

Để chẩn đoán phân biệt bướu cổ đơn thuần và bệnh Basedow về mặt hình thái học, phương pháp chủ yếu dựa vào chẩn đoán tế bào học chọc hút bằng kim nhỏ (FNA). Phương pháp này cho phép đánh giá các tế bào tuyến giáp dưới kính hiển vi, giúp phân biệt các đặc điểm tế bào học của bướu cổ đơn thuần (thường là tế bào nang giáp bình thường hoặc tăng sản lành tính) với bệnh Basedow (thường có các tế bào tăng hoạt động, có thể có lympho bào xâm nhập). Các phương pháp khác như tổn thương đại thể, sinh thiết mô bệnh học hoặc ghi hình phóng xạ có thể hỗ trợ chẩn đoán nhưng không phải là phương pháp chính để phân biệt hai bệnh này về mặt hình thái học tế bào.