Nguồn kinh phí hoạt động trong các đơn vị HCSN gồm:

Đơn vị hành chính sự nghiệp (HCSN) hoạt động chủ yếu bằng các nguồn kinh phí được cấp hoặc tự tạo ra để thực hiện các chức năng, nhiệm vụ được giao. Các nguồn này bao gồm kinh phí hoạt động thường xuyên, kinh phí từ các dự án, chương trình mục tiêu (nếu có), và các nguồn thu hợp pháp khác. Nguồn vốn kinh doanh không phải là nguồn kinh phí hoạt động chủ yếu của các đơn vị HCSN, mà thường liên quan đến các đơn vị có hoạt động sản xuất, kinh doanh.