Khi nghiên cứu nhiều hậu quả của cùng một nguyên nhân thì nên sử dụng thiết kế nghiên cứu:

Thiết kế nghiên cứu thuần tập (cohort study) là thiết kế theo dõi một nhóm người theo thời gian để xác định mối liên quan giữa các yếu tố nguy cơ và kết quả. Do đó, nó phù hợp nhất để xác lập mối liên quan về thời gian giữa các yếu tố. Các thiết kế nghiên cứu khác như tương quan, ngang và bệnh chứng không trực tiếp theo dõi đối tượng theo thời gian để xác định mối liên quan nhân quả theo thời gian.

Nghiên cứu thuần tập theo dõi một nhóm người theo thời gian để xem ai phát triển bệnh và ai không. Do thời gian theo dõi dài, việc mất theo dõi (những người không còn tham gia nghiên cứu) là một vấn đề lớn. So với các nghiên cứu quan sát khác (ví dụ: nghiên cứu cắt ngang), nghiên cứu thuần tập thường có tỷ lệ mất theo dõi cao hơn đáng kể vì cần thời gian dài để thu thập dữ liệu và sự thay đổi trong cuộc sống của đối tượng nghiên cứu.

Nghiên cứu bệnh chứng dễ bị ảnh hưởng bởi yếu tố nhiễu hơn so với các nghiên cứu quan sát khác (như nghiên cứu đoàn hệ) vì:

1. Tính hồi cứu: Dữ liệu được thu thập từ quá khứ, dựa vào trí nhớ của người tham gia, dễ dẫn đến sai lệch thông tin, đặc biệt là về các yếu tố phơi nhiễm. Điều này làm tăng khả năng xuất hiện các yếu tố nhiễu không được kiểm soát.
2. Khó xác định mối quan hệ nhân quả: Vì nghiên cứu bệnh chứng bắt đầu với kết quả (bệnh) và tìm ngược lại nguyên nhân (phơi nhiễm), việc xác định mối quan hệ nhân quả thực sự trở nên khó khăn hơn, dễ bị ảnh hưởng bởi các yếu tố khác.
3. Chọn mẫu: Việc chọn nhóm chứng phù hợp là rất quan trọng nhưng cũng rất khó khăn. Nếu nhóm chứng không đại diện cho quần thể mà nhóm bệnh xuất phát, các yếu tố nhiễu có thể xuất hiện do sự khác biệt giữa hai nhóm không liên quan đến phơi nhiễm đang nghiên cứu.

Do đó, yếu tố nhiễu trong nghiên cứu bệnh chứng thường ở mức cao so với các nghiên cứu quan sát khác.

Giai đoạn "Đặt vấn đề" là giai đoạn đầu tiên và quan trọng nhất trong nghiên cứu khoa học nói chung và nghiên cứu sức khỏe nói riêng. Nó bao gồm việc xác định một vấn đề sức khỏe cụ thể, đánh giá tầm quan trọng của vấn đề, và xác định mục tiêu nghiên cứu. Các giai đoạn khác như mô tả, tổng quan, đối tượng nghiên cứu là các bước tiếp theo sau khi vấn đề đã được xác định rõ ràng.

Nghiên cứu ngang (cross-sectional study) là một loại nghiên cứu quan sát, trong đó dữ liệu được thu thập tại một thời điểm duy nhất hoặc trong một khoảng thời gian ngắn. Mục đích của nghiên cứu ngang thường là mô tả đặc điểm của một quần thể tại một thời điểm cụ thể hoặc để khám phá mối liên quan giữa các biến số. Vì vậy, nghiên cứu ngang thuộc về nghiên cứu mô tả.