Công cụ nghiên cứu văn hóa mang tính tổng hợp là:

Đô thị Việt Nam truyền thống, ngoài chức năng hành chính, còn là trung tâm kinh tế, văn hóa, tôn giáo của một vùng. Tuy nhiên, chức năng chính trị (hành chính) thường được xem là chức năng chủ yếu, nổi bật hơn cả, thể hiện quyền lực của nhà nước phong kiến. Các hoạt động kinh tế, văn hóa cũng chịu sự chi phối của yếu tố chính trị. Do đó, đáp án A là phù hợp nhất.

Các đáp án khác:
- B. Kinh tế: Đô thị có chức năng kinh tế, nhưng không phải là chức năng chủ yếu mang tính quyết định.
- C. Văn hóa: Đô thị là trung tâm văn hóa, nhưng chức năng này cũng không phải là chức năng chủ yếu.

Chữ Quốc ngữ là hệ thống chữ viết tiếng Việt hiện đại, được xây dựng dựa trên bảng chữ cái Latinh. Nó được tạo ra bởi các nhà truyền giáo phương Tây, đặc biệt là Alexandre de Rhodes, một nhà truyền giáo người Pháp. Ông đã hệ thống hóa các ghi chép trước đó của các nhà truyền giáo Bồ Đào Nha và Tây Ban Nha để tạo ra một hệ thống chữ viết hoàn chỉnh hơn, dễ sử dụng hơn cho việc truyền bá đạo Công giáo. Vì vậy, đáp án đúng là A.

Câu ca dao đề cập đến "chữ Trung, chữ Hiếu, chữ Tinh". Đây là những phẩm chất đạo đức được Nho giáo đề cao. Do đó, câu ca dao thể hiện sự ảnh hưởng của văn hóa Nho giáo.

Câu tục ngữ "Ta về ta tắm ao ta, dù trong dù đục ao nhà vẫn hơn" thể hiện tư tưởng trọng cái của mình, nơi mình sinh ra, lớn lên, dù nó có thể không bằng nơi khác. Điều này có thể dẫn đến việc không muốn tiếp thu cái mới, cái tiến bộ từ bên ngoài, từ đó hình thành nên tính bảo thủ. Các lựa chọn khác không phù hợp vì:
- Chủ nghĩa cục bộ địa phương: thiên về lợi ích của địa phương mình hơn lợi ích chung.
- Tính tập thể: đề cao vai trò của tập thể.
- Tính tự quản: khả năng tự quản lý, điều hành công việc của một tổ chức, cộng đồng.

Luận điểm "Càng gần trung tâm, ảnh hưởng của văn hóa gốc càng sâu đậm, càng xa trung tâm, ảnh hưởng của văn hóa gốc càng phai nhạt" là một trong những kết luận chính được rút ra từ công cụ nghiên cứu Địa - văn hóa. Địa - văn hóa xem xét mối quan hệ giữa không gian địa lý và các yếu tố văn hóa. Nó nghiên cứu sự phân bố, lan tỏa và biến đổi của các hiện tượng văn hóa trong không gian, cũng như tác động của môi trường địa lý đến văn hóa và ngược lại.

Phương án A không đúng vì giao lưu - tiếp biến văn hóa tập trung vào quá trình tương tác và thay đổi văn hóa giữa các cộng đồng khác nhau, chứ không nhấn mạnh sự suy giảm ảnh hưởng theo khoảng cách địa lý.

Phương án C không đúng vì nhân học - văn hóa nghiên cứu về con người và văn hóa của họ, thường tập trung vào các khía cạnh như phong tục tập quán, tín ngưỡng, giá trị, v.v., mà không đặc biệt nhấn mạnh yếu tố địa lý.

Phương án D không đúng vì tọa độ văn hóa là một khái niệm trừu tượng hơn, thường được sử dụng để định vị một nền văn hóa trong một hệ thống các giá trị và ý nghĩa, chứ không trực tiếp liên quan đến sự suy giảm ảnh hưởng theo khoảng cách địa lý.

Vì vậy, đáp án đúng nhất là B.